Test de roturas de doble cadena del ADN espermático (Sci Rep 2023)

Scientific Reports · Volumen 13 · Artículo 18996 · 2023

Test rápido de roturas de doble cadena del ADN espermático

Un ensayo sin electroforesis, el R11, da valores parecidos a los del cometa neutro en 15 muestras. En 140 parejas con PGT-A discrimina la tasa de aneuploidía con un AUC de 0,66, y de 0,68 al excluir a las mujeres de más de 38 años. No mide embarazo ni recién nacido vivo.

«Innovative technology for evaluation of sperm DNA double-strand breaks diagnoses male factor infertility and prevents reproductive failures»

Tse-En Wang, Chun-I. Lee (contribución igual), Chun-Chia Huang, Hui-Mei Tsao, Hui-Chen Chang, Li-Sheng Chang, T. Arthur Chang, Maw-Sheng Lee y Cheng-Teng Hsu (correspondencia: M.-S. Lee y C.-T. Hsu).
Center for Research and Development, Bonraybio Co., Ltd.; Division of Infertility Clinic, Lee Women’s Hospital; Chung Shan Medical University, y National Chung Hsing University (Taichung, Taiwán). Department of Obstetrics and Gynecology, University of Texas Health Science Center (San Antonio, EE. UU.).

Estudio observacional + validación de laboratorio 640 hombres · 140 parejas con PGT-A · un solo centro DOI 10.1038/s41598-023-46049-4
Qué tipo de evidencia es Tiene dos partes. Una es de laboratorio: poner a punto el ensayo y compararlo con el cometa neutro y con daño provocado con enzimas y con peróxido. La otra es observacional, de un solo centro: correlaciones con el seminograma en una cohorte de hombres y, en las parejas con PGT-A, curvas ROC frente a la tasa de aneuploidía. No hay intervención ni desenlaces reproductivos. El título del artículo dice que la técnica «diagnostica la infertilidad masculina» y «previene fallos reproductivos»; el estudio no mide ni lo uno ni lo otro.
Transparencia · financiación y conflictos El test evaluado, el LensHooke R11, es un producto de Bonraybio Co., Ltd., que financia el estudio y lo firma. Uno de los dos autores de correspondencia, C.T. Hsu, es el propietario de la empresa, y otros tres autores (T.E. Wang, H.C. Chang y L.S. Chang) son empleados. Lee Women’s Hospital, donde se obtuvieron las muestras, colaboró con Bonraybio en el proyecto y también lo financia. T.A. Chang declara apoyo no económico de la empresa. Bonraybio tiene patentado el kit, con patentes concedidas o solicitudes publicadas en Taiwán, China, EE. UU. y Europa.
!

El problema, en una frase. Los métodos habituales de fragmentación del ADN espermático miden el daño total y no separan las roturas de cadena simple de las de doble cadena. Para las de doble cadena existe el cometa neutro, que según los autores es lento, laborioso y sin un criterio de lectura estándar.

La pregunta

¿Se pueden medir las roturas de doble cadena sin electroforesis?

Las pruebas de fragmentación que recoge la guía de la OMS (TUNEL, dispersión de cromatina, SCSA y cometa) cuantifican la fragmentación «total». Ninguna distingue si la rotura afecta a una hebra o a las dos.

La diferencia importa, según el artículo, porque las roturas de doble cadena se reparan peor. El cometa neutro las detecta, pero exige electroforesis, lleva tiempo y cada laboratorio calcula el índice con fórmulas distintas. Eso, dicen los autores, limita su uso en clínica.

La propuesta es aprovechar una propiedad física de estas roturas: los fragmentos que liberan quedan atrapados en un gel de poliacrilamida con el tamaño de poro adecuado y forman un halo alrededor de la cabeza del espermatozoide. La cromatina intacta no lo forma.

Las preguntas del estudio: ¿da este ensayo, el R11, valores comparables al cometa neutro?, ¿responde a las roturas de doble cadena y no a las de cadena simple?, ¿y se asocia con la aneuploidía de los embriones?

Los resultados

AUC de 0,66 a 0,68 para la aneuploidía; la fragmentación total, 0,56 y 0,50

Los autores señalan el R11 como el único de los cinco parámetros seminales con valor predictivo. En el modelo sin excluir a nadie, la edad de la mujer (0,70) y la del hombre (0,67) discriminan igual o más que el R11. El artículo no publica intervalos de confianza para ninguna AUC.

AUC 0,68
R11 frente a tasa de aneuploidía alta, excluyendo a las mujeres de más de 38 años
p = 0,002 · 24 casos de tasa alta frente a 63 de tasa baja · sin excluir a nadie: 0,66 (p = 0,0007)
AUC 0,50
Fragmentación total (R10) en el mismo modelo
Sin excluir a nadie: 0,56 · R11 y R10 correlacionan entre sí con r de Spearman 0,8054
35 frente a 141,5 min
Tiempo medio de trabajo del R11 frente al cometa neutro
Dato de la discusión; el desglose está en el material suplementario
11,1 % frente a 10,1 %
Índice de roturas de doble cadena con R11 y con cometa neutro, 15 muestras
Sin diferencia · sesgo medio 1,0 punto · límites de concordancia del 95 % de −4,7 a 6,8

Capacidad de cada parámetro para separar las parejas con tasa de aneuploidía alta

Área bajo la curva ROC, escala de 0 a 1. La línea discontinua marca el azar. Tasa alta: al menos el 50 % de los blastocistos biopsiados aneuploides. Sin intervalos de confianza publicados.

R11 · roturas de doble cadena Seminograma y R10 · fragmentación total Edad de los progenitores

Todas las parejas

60 con tasa alta frente a 80 con tasa baja

R11
0,66
R10
0,56
Concentración
0,54
Motilidad total
0,58
Morfología normal
0,58
Edad de la mujer
0,70
Edad del hombre
0,67

Sin mujeres de más de 38 años

24 con tasa alta frente a 63 con tasa baja

R11
0,68
R10
0,50
Concentración
0,55
Motilidad total
0,61
Morfología normal
0,58
Edad de la mujer
0,51
Edad del hombre
0,61

El umbral del R11 con mejor equilibrio entre sensibilidad y especificidad es > 8 %. Los valores de sensibilidad y especificidad de ese umbral no están en el texto del artículo, solo en una tabla suplementaria. El «ajuste» no es un modelo multivariante: consiste en excluir a las parejas con la mujer mayor de 38 años.

Especificidad en el laboratorio. Con peróxido de hidrógeno, que según el artículo causa sobre todo roturas de cadena simple, la fragmentación total (R10) sube del 18,5 % al 92,3 % con H2O2 al 0,3 %. El R11 pasa del 12,2 % al 22,2 %, sin diferencia significativa con el control. Con las enzimas que el artículo usa para simular roturas de doble cadena, el R11 sube del 13,7 % al 89,0 % tras 30 minutos de DNasa I, y del 13,3 % al 92,5 % tras 40 minutos de Alu I.

Ver las correlaciones del R11 con el seminograma (639 hombres)
R11 frente a…r de Spearmanp
Concentración espermática0,018680,6373
Motilidad total−0,2732< 0,0001
Motilidad progresiva−0,1236no concuerda (ver abajo)
Morfología normal−0,1870< 0,0001
Edad del hombre0,3694< 0,0001
Fragmentación total (R10)0,8054< 0,0001

La p de la motilidad progresiva es 0,0027 en el texto y 0,0017 en la figura; aquí no se elige ninguna.

El método

Cómo se hizo

1

A quién se incluyó

640 hombres de 20 a 60 años que acudieron a tratamiento de reproducción en Lee Women’s Hospital (Taichung) de mayo de 2020 a diciembre de 2021. Se excluyó la azoospermia y la eyaculación retrógrada.

De ellos, 140 parejas tuvieron dos o más embriones con PGT-A.

2

Qué se midió a todos

Seminograma con analizador automático (concentración, motilidad total y progresiva) y dos índices de fragmentación del mismo fabricante: el R10, de dispersión de cromatina, para el daño total, y el R11 para las roturas de doble cadena.

3

Cómo funciona el R11

El semen se mezcla con poliacrilamida, que polimeriza sobre el portaobjetos en 5 minutos; sigue una lisis de 10 minutos y una tinción. Un halo grande o mediano indica roturas de doble cadena. Se cuentan al menos 500 espermatozoides.

La concentración del gel se probó en 5 muestras: al 7 % salía un 76,9 % de halos (falsos positivos) y por encima del 13 % el gel no dejaba dispersarse los fragmentos. Se eligió el 12 %.

4

Cómo se midió el desenlace

Tasa de aneuploidía por blastocisto biopsiado. Un embrión contaba como aneuploide con un mosaicismo de más del 80 %, y la tasa era alta desde el 50 %.

Curvas ROC para cada parámetro, primero con todas las parejas y después sin las mujeres de más de 38 años. Validación previa del R11 frente a cometa neutro, enzimas y peróxido.

Antes de citarlo

Incoherencias internas del artículo

Cada punto de esta lista se puede comprobar en el propio artículo: son frases y cifras del texto que no concuerdan entre sí o con el título.

  1. El título promete lo que no se mide. Habla de diagnosticar la infertilidad masculina y de prevenir fallos reproductivos. No hay grupo de hombres fértiles ni ningún desenlace de embarazo, aborto o recién nacido: solo correlaciones y un AUC frente a la tasa de aneuploidía.
  2. El diseño cambia de nombre. El apartado de ética lo llama «estudio de cohorte prospectivo»; el resumen, «estudio retrospectivo»; la discusión, «ensayo de un solo centro».
  3. 640 o 639. Se reclutan 640 hombres y todas las correlaciones de la figura 4 se hacen con 639, sin explicación.
  4. Un gel que no se probó. Se ensayaron concentraciones del 7 al 25 % y el 12 %, que es el que se usa después, no estaba entre ellas. El resumen habla de un óptimo entre el 10 y el 13 %.
  5. «Alta sensibilidad y especificidad» sin cifras. Se afirma a partir de muestras con daño provocado en el laboratorio. En el texto no hay valores de sensibilidad ni de especificidad clínicas.
  6. «Se mantuvo en niveles basales». Así describe el texto al R11 con peróxido, y la figura lo muestra subiendo del 12,2 % al 22,2 % con la dosis más alta, sin significación.
  7. Dos p para la misma correlación. Motilidad progresiva: p = 0,0027 en el texto, p = 0,0017 en la figura.

La letra pequeña

Lo que los autores reconocen de su propio trabajo

El artículo no tiene apartado de limitaciones. Les dedica una sola frase en la discusión, con dos puntos: un solo centro y una muestra pequeña.

Un solo centro

Todas las muestras vienen de Lee Women’s Hospital. Los autores lo citan como la primera limitación del estudio.

Muestra pequeña

El análisis de aneuploidía se apoya en 140 parejas, y el modelo sin mujeres de más de 38 años en 24 casos de tasa alta. Los autores escriben que se necesitan más ensayos clínicos para consolidar la relación entre el R11 y los fracasos de la reproducción asistida.

«Hemos desarrollado un ensayo rápido para evaluar las roturas de doble cadena del espermatozoide, que no requiere electroforesis y tiene criterios estándar para interpretar el índice de fragmentación; estas ventajas son útiles para mejorar la eficacia del análisis seminal en la práctica clínica.»

«In conclusion, we developed a rapid assay for evaluating sperm DSBs, which does not require electrophoresis and has standard criteria for DFI interpretation; these advantages are beneficial to improve the effectiveness of semen analysis in clinical practice.»

Wang TE, Lee CI et al. Scientific Reports, 2023. Conclusión del artículo. La frase siguiente atribuye al R11 el «diagnóstico precoz de la aneuploidía embrionaria»; es una afirmación de los autores que el estudio no pone a prueba.
→

Ver también. La serie tiene la ficha de un resumen de congreso de un grupo independiente (CIMAB, ASEBIR) que comparó el R11 con el Cometa Neutro, el TUNEL y el SCD sobre las mismas muestras. Su conclusión sobre la comparación con el cometa neutro no coincide con la de este estudio: El kit R11 no equivale a Cometa, TUNEL ni SCD.

Para citarlo

La referencia

Wang TE, Lee CI, Huang CC, Tsao HM, Chang HC, Chang LS, Chang TA, Lee MS, Hsu CT. Innovative technology for evaluation of sperm DNA double-strand breaks diagnoses male factor infertility and prevents reproductive failures. Sci Rep. 2023;13:18996. doi:10.1038/s41598-023-46049-4

Leer el artículo original · Acceso abierto bajo licencia CC BY
Esta ficha se ha elaborado sobre el artículo original, sin añadir datos ni interpretaciones ajenas al texto. Cada cifra se ha verificado contra el texto y las figuras del artículo antes de maquetarla. Donde el texto y las figuras no coinciden, se dice. Enlaza al artículo para quien quiera leerlo completo.
Código AdrIA · serie «papers legibles»